MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium sp. MCS chromosome

Total Repeats: 8477

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008146	TCC	2	6	3240377	3240382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5002	NC_008146	CAC	2	6	3240397	3240402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5003	NC_008146	GCG	2	6	3240410	3240415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_008146	CGA	2	6	3240501	3240506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_008146	CGG	2	6	3240555	3240560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_008146	TGC	2	6	3240566	3240571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_008146	GGT	2	6	3241448	3241453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_008146	CTC	2	6	3244977	3244982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5009	NC_008146	CCT	2	6	3248895	3248900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5010	NC_008146	GCCGA	2	10	3248919	3248928	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5011	NC_008146	GCC	2	6	3253258	3253263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5012	NC_008146	GCG	2	6	3253286	3253291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_008146	GCC	2	6	3253307	3253312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5014	NC_008146	GTC	2	6	3263470	3263475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_008146	TTG	2	6	3263506	3263511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_008146	TCG	2	6	3263519	3263524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_008146	GTC	2	6	3267756	3267761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_008146	TCC	2	6	3270116	3270121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5019	NC_008146	CAT	2	6	3272700	3272705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_008146	GAC	2	6	3282193	3282198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_008146	ACC	2	6	3282226	3282231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5022	NC_008146	CGC	2	6	3282253	3282258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5023	NC_008146	CCCG	2	8	3282284	3282291	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5024	NC_008146	CCA	2	6	3282303	3282308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5025	NC_008146	TTC	2	6	3282321	3282326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_008146	TACGC	2	10	3283038	3283047	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5027	NC_008146	GT	3	6	3283049	3283054	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_008146	GGC	2	6	3284309	3284314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_008146	GAC	2	6	3284315	3284320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_008146	GGTA	2	8	3284343	3284350	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_008146	CAC	2	6	3284378	3284383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5032	NC_008146	CGGC	2	8	3286262	3286269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5033	NC_008146	GCC	2	6	3286278	3286283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5034	NC_008146	CGC	2	6	3287307	3287312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5035	NC_008146	CGC	2	6	3288820	3288825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5036	NC_008146	GC	3	6	3288920	3288925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5037	NC_008146	CG	3	6	3288979	3288984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5038	NC_008146	GAG	2	6	3288992	3288997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_008146	AC	3	6	3290684	3290689	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5040	NC_008146	GCCT	2	8	3290690	3290697	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5041	NC_008146	CCT	2	6	3291657	3291662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5042	NC_008146	C	7	7	3293553	3293559	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5043	NC_008146	CCGG	2	8	3293584	3293591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5044	NC_008146	GAC	2	6	3293617	3293622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_008146	TGCC	2	8	3293627	3293634	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5046	NC_008146	GC	3	6	3295009	3295014	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5047	NC_008146	GGC	2	6	3295015	3295020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_008146	TCCG	2	8	3310350	3310357	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5049	NC_008146	TCA	2	6	3310514	3310519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_008146	CGA	2	6	3310660	3310665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_008146	GC	3	6	3310675	3310680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5052	NC_008146	TGA	2	6	3310705	3310710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_008146	CAG	2	6	3310722	3310727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_008146	CCA	2	6	3310871	3310876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5055	NC_008146	AC	3	6	3310897	3310902	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5056	NC_008146	CGG	2	6	3310916	3310921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_008146	CTG	2	6	3310949	3310954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_008146	ACA	2	6	3310972	3310977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_008146	CG	3	6	3310988	3310993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5060	NC_008146	GTG	2	6	3310994	3310999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_008146	TGT	2	6	3317519	3317524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_008146	TGAC	2	8	3317534	3317541	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5063	NC_008146	ATG	2	6	3317561	3317566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_008146	CCG	2	6	3317583	3317588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5065	NC_008146	CA	3	6	3320370	3320375	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5066	NC_008146	GCG	2	6	3320376	3320381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_008146	AAC	2	6	3320382	3320387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_008146	GC	3	6	3322952	3322957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5069	NC_008146	CGT	2	6	3322986	3322991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_008146	CAG	2	6	3323002	3323007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_008146	GTC	2	6	3323008	3323013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_008146	GCC	2	6	3323059	3323064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5073	NC_008146	GTC	3	9	3323071	3323079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_008146	CGC	3	9	3323082	3323090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5075	NC_008146	CGC	2	6	3323122	3323127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5076	NC_008146	TCC	2	6	3323170	3323175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5077	NC_008146	GCC	2	6	3324828	3324833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5078	NC_008146	GTG	2	6	3326720	3326725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_008146	AAC	2	6	3326730	3326735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_008146	TG	3	6	3326762	3326767	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_008146	AC	3	6	3326783	3326788	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5082	NC_008146	GCA	2	6	3326791	3326796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_008146	GCA	3	9	3326870	3326878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_008146	GTA	2	6	3326882	3326887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_008146	TGG	2	6	3326890	3326895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_008146	CCGT	2	8	3327330	3327337	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5087	NC_008146	GC	3	6	3329055	3329060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5088	NC_008146	G	6	6	3329094	3329099	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_008146	GGC	2	6	3334372	3334377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_008146	CAG	2	6	3334404	3334409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_008146	CAC	2	6	3334412	3334417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5092	NC_008146	AAC	2	6	3334428	3334433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_008146	CAA	3	9	3334439	3334447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_008146	ACG	2	6	3334464	3334469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_008146	GTC	2	6	3334485	3334490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_008146	TCG	2	6	3337621	3337626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_008146	CCGG	2	8	3337656	3337663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5098	NC_008146	GCG	2	6	3337702	3337707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_008146	GC	3	6	3338409	3338414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5100	NC_008146	CCG	2	6	3338421	3338426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5101	NC_008146	CGA	2	6	3338482	3338487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_008146	GGT	2	6	3342176	3342181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_008146	TCG	2	6	3342186	3342191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_008146	TTCC	2	8	3342295	3342302	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5105	NC_008146	CGT	2	6	3342405	3342410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_008146	CGC	2	6	3342442	3342447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5107	NC_008146	TTTCG	2	10	3342519	3342528	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5108	NC_008146	GCC	2	6	3342552	3342557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5109	NC_008146	GTG	2	6	3342567	3342572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_008146	CAG	3	9	3342584	3342592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_008146	CCG	2	6	3342624	3342629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5112	NC_008146	GTT	2	6	3347143	3347148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_008146	TGG	2	6	3347169	3347174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_008146	ACG	2	6	3347196	3347201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_008146	GCA	2	6	3347202	3347207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_008146	GTG	2	6	3348763	3348768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_008146	GCC	2	6	3348792	3348797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5118	NC_008146	ACCGT	2	10	3350984	3350993	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5119	NC_008146	CCA	2	6	3351320	3351325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5120	NC_008146	GGTC	2	8	3351368	3351375	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5121	NC_008146	CTCCC	2	10	3357574	3357583	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
5122	NC_008146	GC	3	6	3357628	3357633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5123	NC_008146	CG	3	6	3357643	3357648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5124	NC_008146	CCTC	2	8	3357684	3357691	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5125	NC_008146	GAGC	2	8	3357729	3357736	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5126	NC_008146	GA	3	6	3360709	3360714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_008146	CTA	2	6	3361150	3361155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_008146	GA	3	6	3361224	3361229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_008146	CGC	2	6	3361309	3361314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5130	NC_008146	GGC	2	6	3361320	3361325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_008146	GGAT	2	8	3361359	3361366	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_008146	GAC	2	6	3361370	3361375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5134	NC_008146	GCT	2	6	3363158	3363163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5139	NC_008146	CGCT	2	8	3363331	3363338	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5142	NC_008146	GCAT	2	8	3363405	3363412	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5236	NC_008146	GAG	2	6	3409258	3409263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5242	NC_008146	GTC	2	6	3415055	3415060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5244	NC_008146	C	6	6	3418315	3418320	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5245	NC_008146	CAAA	2	8	3419830	3419837	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5246	NC_008146	ATCGG	2	10	3419866	3419875	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5250	NC_008146	GCC	2	6	3420077	3420082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5251	NC_008146	GGTT	2	8	3425135	3425142	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5252	NC_008146	GGC	2	6	3425186	3425191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5253	NC_008146	GCC	2	6	3425201	3425206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5254	NC_008146	CGA	2	6	3425237	3425242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5255	NC_008146	CCG	2	6	3425245	3425250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5256	NC_008146	AAC	2	6	3425254	3425259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5257	NC_008146	CGG	2	6	3428467	3428472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5258	NC_008146	CG	3	6	3429598	3429603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5259	NC_008146	TCG	2	6	3429609	3429614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5260	NC_008146	CGC	2	6	3438801	3438806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5261	NC_008146	TCG	2	6	3438808	3438813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5342	NC_008146	CGACG	2	10	3519341	3519350	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5343	NC_008146	CGACG	2	10	3519365	3519374	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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5375	NC_008146	GC	3	6	3550157	3550162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5376	NC_008146	GGAT	2	8	3550163	3550170	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5377	NC_008146	CTTG	2	8	3550287	3550294	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5378	NC_008146	GCCCG	2	10	3550417	3550426	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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5382	NC_008146	GACG	2	8	3551527	3551534	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5384	NC_008146	CGC	2	6	3551566	3551571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5385	NC_008146	ATCG	2	8	3553371	3553378	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5386	NC_008146	CT	3	6	3553382	3553387	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5387	NC_008146	CTGA	2	8	3557601	3557608	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5388	NC_008146	GCCAC	2	10	3557644	3557653	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5389	NC_008146	CCACT	2	10	3557659	3557668	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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